Iskolánknak számos olyan díja van, amelyeket öregdiákjaink alapítottak és gondoznak. Ezeket az elismeréseket az arra legméltóbb diákjainknak a tanévzárón adjuk át.
CZIRÁKI Alapítvány („pro cultura humana”) díja; Cziráki László atya tanítványai által alapított díj a humán műveltség területén végzett kiemelkedő munkáért.
MATTYASOVSZKY KASSZIÁN-díj; Bencés Öregdiákok által alapított díj egy XII. osztályos tanuló matematika/fizika tanulmányainak elismeréseként.
HUNYADI MÁTYÁS-díj; jó tanuló – jó sportoló számára a kőszegi bencés öregdiákok díja.
ZSOLDOS XAVÉR-díj; eredetileg a Herendi Porcelánmanufaktúra által alapított díj, a művészettörténet és a rajz tantárgyakban nyújtott kiemelkedő teljesítményért.
LUIF OTMÁR ALAPÍTVÁNY díja; egy-egy győri és pannonhalmi – a biológia vagy a földrajz tudományok területén kimagasló képességű – diák kapja meg.
FAGGYAS EDVIN-díj; Bencés Öregdiákok – Edvin atya tanítványai – alapították az arra legérdemesebb XI. osztályos tanuló számára, aki szorgalommal és kitartással eredményesen tanulja a kémiát.
SÖVEGES DÁVID-díj; mindig egy XI. osztályos tanuló kapja, irodalmi munkájáért.
PÁSZTHORY VALTER ALAPÍTVÁNY díja; pályázati dolgozat alapján az alapítók, Rill Attila és Visontai-Kovách Zoltán adják át.
KOVÁTS ARISZTID-díj; legrangosabb elismerésünk; Jávor Egon bencés atya alapította hálából bencés neveléséért és hivatásáért. Az a végzős diák kapja, aki ittléte alatt felfedezi és befogadja a pannonhalmi diákélet értékeit.