A pannonhalmi gimnáziumot és kollégiumot 1939-ben kezdték építeni. Teleki Pál miniszterelnök és az akkori főapát, Kelemen Krizosztom „olasz” gimnáziumot szeretett volna itt indítani, amelyben nagy hangsúlyt kap az olasz nyelv és kultúra oktatása.
A kezdet kezdetén tízéves korukban kerültek ide a fiúk, egy osztályban huszonöten voltak, az iskolát pedig nyolcosztályosra tervezték. A magyar és a hazai bencés iskolák történetében teljesen új megoldásnak számított, hogy a gimnázium és a kollégium egybeépült. Az osztályközösség a diákotthonban is együtt maradt, egy hálóban lakott, az osztályfőnök pedig többnyire diákotthoni nevelő (prefektus) is volt.
A pannonhalmi iskolát 1948 júniusában államosították, a monostorral összekötő folyosókat lefalazták.
Az iskola mint bencés gimnázium 1950-ben indulhatott újra és egyike volt annak a nyolc katolikus gimnáziumnak, amely a kommunizmus éveiben is fennmaradhatott Magyarországon.
A pannonhalmi olasz gimnázium létrejöttéről Pelles Tamás, volt győri bencés diák írt részletes tanulmányt, amely az Iskolakultúra c. pécsi folyóiratban jelent meg 2000-ben.
A Pannonhalmi Bencés Gimnázium igazgatói:
- Kováts Arisztid (1939-1945)
- Jámbor Mike (1945-1947)
- Hajdú Lukács (1947-1948)
- Legányi Norbert (1950-1952)
- Monsberger Ulrik (1952-1956)
- Söveges Dávid (1956-1957)
- Vályi Hugó (1957-1962)
- Monsberger Ulrik (1962-1965)
- Kapuy Vitál (1965-1973)
- Jáki Zénó (1973-1977)
- Csóka Gáspár (1977-1979)
- Korzenszky Richárd (1979-1989)
- Pintér Ambrus (1989-1994)
- Hortobágyi Cirill (1994-1996)
- Horváth Dori Tamás (1996-2006)
- Hardi Titusz (2006-2018)
- Juhász-Laczik Albin (2018-
A Pannonhalmi Bencés Gimnázium hittanárai és hittant is tanító tanárai:
(A hittanároknak (az eredeti elgondolás szerint) fontos szerepük volt iskolánk „belső” arculatának (ki)alakításában. Kezdetben az iskola hittanára nem volt prefektus: ő irányította a hitoktatást, a diákmiséket, a lelkigyakorlatokat és rekollekciókat szervezte, a napi szentmisék és egyéb közös imádságok beosztását a diákkápolnában ő készítette, bármikor be lehetett hozzá menni „belső” problémákkal.)
- Békés Gellért dr. (1940-1945)
- Kövér Alajos dr. (1939-40 és 1945-1950)
- Lébényi Szliárd (1946-1947)
- Söveges Dávid (1946-1947)
- Bajtai Oros dr. (1950 -1962)
- Horváth Patrik (1961-1964)
- Tarnay Brúnó dr. (1962-1970)
- Ruttmayer Ince (1963-1964)
- Horváth Ciprián dr. (1965-1966)
- Áment Lukács dr. (1969-70 és 1974-1997)
- Sulyok Elemér dr. (1971-
- Kiss Barnabás dr. (1978-1982)
- Nyiredy Maurus dr. (1979-1991)
- Kiss Domonkos (1985-1986)
- Janzsó Márton (1991-1998)
- Varga Mátyás (1993-1994)
- Hardi Titusz (1994-96 és 2006-
- Vásárhelyi Anzelm (1994-1996)
- Baumgartner Bernát (1995-
- Szita Bánk (1997-
- Fehérváry Jákó dr. (1997-2008)
- Pintér Ambrus (1999-2008)
- Horváth Dori Tamás (2005)
- Czakó Tibor (2001-2004)
- Juhász-Laczik Albin (2001-2003, 2008-
- Kelemen Áron (2001-2002)
- Lőrincz Krizosztom (2001-2004)
- Ontko Xavér (2002-2004)
- Bajnóczi Gábor (2005-2010)
- Dejcsics Konrád (2007-
- Rochlitz Kyra (2009-
A Pannonhalmi Bencés Gimnázium testnevelés tanárai:
(A testnevelés tanároknak főképp a diákotthoni élet (ki)egyensúlyozásában volt/van nagy szerepük, hogy a többnyire „szellemi” tevékenységet végző diákjaink mozgásigényüket rendszeresen, szervezetten kielégíthessék. Ez a testnevelési órákon túl a különböző sportfoglalkozásokat (edzéseket), kirándulásokat, (nyári és téli, hegyi és vízi) túrákat és más szabadidős tevékenységek szervezését jelenti.)
- Bálint Béla Károly (1939-1941)
- Farkas Sándor (1941-1942)
- Csergezán László (1942-1944)
- László István (1944-1947)
- Faggyas Edvin (1950-1955)
- Rozmán Tivadar (1954-1960)
- Tálos Zoltán (1960-1990)
- Török Loránd (1990-
- Erdőssy István (1994-
A Pannonhalmi Bencés Gimnázium énektanárai:
(További fontos szerepe volt/van diákotthonunk életében az énektanárnak, aki az órák megtartásán túl az énekkar, az egyházi ének, a zenehallgatás (Collegium Musicum), az ifjúsági Filharmóniai Hangversenyek és más zenei események megszervezését (és az azokra való lelkesítését) is jelenti.)
- Linzer (Lébényi) Szilárd (1939-1942)
- Szigeti Kilián dr. (1942-1980)
- Áment Lukács dr. (1974-2006)
- Tokodi Veronika (2004-2006)
- Kiss Zsolt (2006-